Для начала, вы взяли проект из примеров или свой? Возьмите для теста рабочий пример со светодиодами. Совет два - после
сделайте очистку и полную пересборку проекта, можно даже удалить всю папку Debug чтобы точно вычистить старые компилы. Убедитесь, что проект собрался без ошибок. И потом запускайте отладку как обычно, все должно прошиться и встать на мейн. Еще, может быть, у вас повредилась отладочная конфигурация и он не может найти выходной файл Example_LED_blinking.elf, возможно он лежит не по тому пути, по-другому называется или поврежден.Я выбрал файл разметки niiet_flash.ld в файле build.ld
Ну и коллега посоветовал традиционное "выйти и войти снова" - перезагрузите всё.